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研究成果（ReaD&Researchmapへ）

学術論文

  1. T. KUSHIDA, I. NARUMI, S. ISHINO, Y. ISHINO, S. FUJIWARA, T. IMANAKA, and H. HIGASHIBATA: “PolB, a family B DNA polymerase, in Thermococcus kodakarensis is important for DNA repair but not DNA replication”. Microbes and Environments, 34 (3), 316-326, 2019
  2. S. SANO, Y. YAMADA, T. SHINKAWA, S. KATO, T. OKADA, H. HIGASHIBATA, and S. FUJIWARA: “Mutations to create thermostable reverse transcriptase with bacterial family A DNA polymerase from Thermotoga petrophila K4”. Journal of Bioscience and Bioengineering, 113 (3), 315-321, 2012
  3. Y. MATSUNO, A. SUGAI, H. HIGASHIBATA, W. FUKUDA, K. UEDA, I. UDA, I. SATO, T. ITOH, T. IMANAKA, and S. FUJIWARA: “Effect of growth temperature and growth phase on lipid composition of archaeal membrane from Thermococcus kodakaraensis”. Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 73(1), 104-108, 2009
  4. S. FUJIWARA, R. AKI, M. YOSHIDA, H. HIGASHIBATA, T. IMANAKA, and W. FUKUDA: “Expression profiles and physiological roles of two types of molecular chaperonins from the hyperthermophilic archaeon, Thermococcus kodakaraensis”. Applied Environmental Microbiology, 74(23), 7306-7312, 2008
  5. S. FUJIWARA, A. YAMANAKA, Y. YAMADA, K. HIROOKA, H. HIGASHIBATA, W. FUKUDA, J. NAKAYAMA, T. IMANAKA, E. FUKUSAKI: “Efficient synthesis of trans-polyisoprene compounds using two thermostable enzymes in an organic-aqueous dual-liquid phase system”. Biochemical Biophysical Research Communications, 365(1), 118-123, 2008
  6. A. HIRANO, H. HAMADA, T. OKUBO, T. NOGUCHI, H. HIGASHIBATA, and K. SHIRAKI: “Correlation between thermal aggregation and stability of lysozyme with salts described by molar surface tension increment: an exceptional propensity of ammonium salts as aggregation suppressor”. Protein Journal 26(6), 423-433, 2007
  7. T. HIROMOTO, H. MATSUE, M. YOSHIDA, T. TANAKA, H. HIGASHIBATA, K. HOSOKAWA, H. YAMAGUCHI, and S. FUJIWARA: ”Characterization of MobR, the 3-Hydroxybenzoate-responsive Transcriptional Regulator for the 3-Hydroxybenzoate Hydroxylase Gene of Comamonas testosteroni KH122-3s”. Journal of Molecular Biology, 364(5), 863-877, 2006
  8. Y. HASHIMOTO, H. HOSAKA, KI. OINUMA, M. GODA, H. HIGASHIBATA, and M. KOBAYASHI: “Nitrile pathway involving Acyl-CoA synthetase: Overall metabolic gene organization, and purification and characterization of the enzyme”. Journal of Biological Chemistry 280(10), 8660-8667, 2005
  9. KI. OINUMA, H. KUMITA, T. OHTA, K. KONISHI, Y. HASHIMOTO, H. HIGASHIBATA, T. KITAGAWA, Y. SHIRO, and M. KOBAYASHI: “Stopped-flow spectrophotometric and resonance Raman analyses of aldoxime dehydratase involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis”. FEBS Letters, 579(6), 1394-1398, 2005
  10. H. FUKATSU, S. HERAI, Y. HASHIMOTO, H. MASEDA, H. HIGASHIBATA, and M. KOBAYASHI: “High-level expression of a novel amine-synthesizing enzyme, N-substituted formamide deformylase, in Streptomyces with a strong protein expression system”. Protein Expression and Purification, 40(1), 212-219, 2005
  11. H. FUKATSU, M. GODA, Y. HASHIMOTO, H. HIGASHIBATA, and M. KOBAYASHI: “Optimum culture conditions for the production of N-substituted formamide deformylase by Arthrobacter pascens F164”. Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 69(1), 228-230, 2005
  12. K. KONISHI, K. ISHIDA, KI. OINUMA, T. OHTA, Y. HASHIMOTO, H. HIGASHIBATA, T. KITAGAWA, and M. KOBAYASHI: “Identification of crucial histidines in carbon-nitrogen triple bond synthesis by aldoxime dehydratase”. Journal of Biological Chemistry, 279(46), 47619-47625, 2004
  13. S. HERAI, Y. HASHIMOTO, H. HIGASHIBATA, H. MASEDA, H. IKEDA, S. ÔMURA, and M. KOBAYASHI: “Hyper-inducible expression system for streptomycetes”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 101(39), 14031-14035, 2004
  14. H. FUKATSU, Y. HASHIMOTO, M. GODA, H. HIGASHIBATA, and M. KOBAYASHI: “Amine-synthesizing enzyme, N-substituted formamide deformylase: Screening, purification, characterization and gene cloning”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 101(38), 13726-13731, 2004
  15. KI. OINUMA, T. OHTA, K. KONISHI, Y. HASHIMOTO, H. HIGASHIBATA, T. KITAGAWA, and M. KOBAYASHI: “Heme environment in aldoxime dehydratase involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis”. FEBS Letters, 568(1-3), 44-48, 2004
  16. KI. OINUMA, Y. HASHIMOTO, K. KONISHI, M. GODA, T. NOGUCHI, H. HIGASHIBATA, and M. KOBAYASHI: “Novel aldoxime dehydratase involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis of Pseudomonas chlororaphis B23: Sequencing, gene expression, purification and characterization”. Journal of Biological Chemistry, 278(32), 29600-29608, 2003
  17. H. HIGASHIBATA, M. A. SIDDIQUI, M. TAKAGI, T. IMANAKA, and S. FUJIWARA: “Surface histidine residue of archaeal histone affects DNA compaction and thermostability”.FEMS Micobiology Letters, 224(1), 17-22, 2003
  18. H. HIGASHIBATA, H. KIKUCHI, Y. KAWARABAYASI, and I. MATSUI: “Helicase and nuclease activities of hyperthermophile Pyrococcus horikoshii Dna2 inhibited by substrates with RNA segments at 5’-end”. Journal of Biological Chemistry, 278(18), 15983-15990, 2003
  19. M. GODA, Y. HASHIMOTO, M. TAKASE, S. HERAI, Y. IWAHARA, H. HIGASHIBATA, and M. KOBAYASHI: “Isonitrile hydratase from Pseudomonas putida N19-2: Cloning, sequencing, gene expression, and identification of its active amino acid residue”. Journal of Biological Chemistry, 277(48), 45860-45865, 2002
  20. H. HIGASHIBATA, S. FUJIWARA, S. EZAKI, M. TAKAGI, K. FUKUI, and T. IMANAKA: “Effect of polyamines on histone-induced DNA compaction of hyperthermophilic archaea”. Journal of Bioscience and Bioengineering, 89(1), 103-106, 2000
  21. T. MATSUDA, M. MORIKAWA, M. HARUKI, H. HIGASHIBATA, T. IMANAKA, and S. KANAYA: “Isolation of TBP-interacting protein (TIP) from a hyperthermophilic archaeon that inhibits the binding of TBP to TATA-DNA”. FEBS Letters, 457(1), 38-42, 1999
  22. H. HIGASHIBATA, S. FUJIWARA, M. TAKAGI, and T. IMANAKA: “Analysis of DNA compaction profile and intracellular contents of archaeal histones from Pyrococcus kodakaraensis KOD1”. Biochemical Biophysical Research Communications, 258(2), 416-424, 1999

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学会発表【国際学会・国際会議での発表】（2011-2019）○印は発表者を示す。

  1. ○T. KUSHIDA, I. NARUMI, S. ISHINO, Y. ISHINO, and H.HIGASHIBATA: “Overexpression of DNA polymerase D in DNA polymerase B disruptant of Thermococcus kodakarensis” Thermophiles2019, The 15th international congress on Thermophiles, Fukuoka, Japan, 2019.9.5
  2. ○S. KASHIWADA, H. TAKEUCHI, Y. IWASAKI, H. HIGASHIBATA, S. NAGASAKA, M. SAKAMOTO, N. MIYANISHI, H. YAMAMOTO, H. TATSUTA, M. UMEHARA:”Microevolution of aquatic ecosystem in Watarase River, a 100-years heavy metal contamination” 31st ESCPB congress, Porto, Portugal, 2018.9.10
  3. ○H. HIGASHIBATA, D. KITAMURA, S. KASHIWADA:”Characterization of copper-resistant bacterium, Lysinibacillus sp. strain AN20SW1,isolated from Watarase retarding basin in Japan” 31st ESCPB congress, Porto, Portugal, 2018.9.10
  4. ○H. HIGASHIBATA, D. KITAMURA, S. KASHIWADA:”A copper-resistant bacterium, Lysinibacillus sp. strain AN20SW1,isolated from Watarase retarding basin in Japan” Extremophiles2018, The 12th International Congress on Extremophiles, Ischia, Italy, 2018.9.18
  5. ○T. KUSHIDA, I. NARUMI, S. ISHINO, Y. ISHINO, S. FUJIWARA, T. IMANAKA, H. HIGASHIBATA:”Mutant frequency in DNA polymerase B disruptant of Thermococcus kodakarensis.” Extremophiles2016, The 11th International Congress on Extremophiles, Kyoto, Japan, 2016.9.13
  6. ○H. HIGASHIBATA, R. MATSUMI, J. N. REEVE, J. OBERTO, P. FORTERRE:”Reverse gyrase mutants of Thermococcus kodakarensis” Extremophiles2016, The 11th International Congress on Extremophiles, Kyoto, Japan, 2016.9.13
  7. ○H. MARUYAMA, T. KUSHIDA, H. HIGASHIBATA, A. K. EFREMOV, J. YAN, H. ATOMI, K. TAKEYASU:”The role of TrmBL2 protein on chromosome architecture and protection in Thermococcus kodakarensis” Extremophiles2016, The 11th International Congress on Extremophiles, Kyoto, Japan, 2016.9.15
  8. ○T. KUSHIDA, I. NARUMI, S. ISHINO, Y. ISHINO, S. FUJIWARA, T. IMANAKA, H. HIGASHIBATA:” Role of DNA polymerase B in maintenance of chromosomal DNA of Thermococcus kodakarensis in a high-temperature environment.” Thermophiles2015, The13th international conference on Thermophiles research, Santiago, Chile, 2015.9.1
  9. ○T. KUSHIDA, S. ISHINO, Y. ISHINO, S. FUJIWARA, T. IMANAKA, H. HIGASHIBATA:”Role of DNA polymerase B in maintenance of genomic DNA of hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis.” Extremophiles2014, The 10th international congress on Extremophiles, Saint Petersburg, Russia, 2014.9.8
  10. ○H. HIGASHIBATA, T. KUSHIDA, I. NARUMI, S. ISHINO, Y. ISHINO, S. FUJIWARA, T. IMANAKA:”DNA polymerase B from hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis is not essential for cell viability.” Thermophiles2013, The12th international conference on Thermophiles research, Regensburg, Germany, 2013.9.9
  11. ○T. KUSHIDA, I. NARUMI, S. FUJIWARA, T. IMANAKA, H. HIGASHIBATA: “Characteristics of DNA polymerase B in hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis.” The 5th Japan-China-Korea Graduate Student Forum, Tsukuba, Japan, 2012.9.23
  12. ○H. HIGASHIBATA, T. IMANAKA: “Genetic analysis of the genes involved in archaeosine biosynthesis of hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis.” Extremophiles2012 The 9th international congress on Extremophiles, Sevilla, Spain, 2012.9.13　
  13. ○T. KUSHIDA, I. NARUMI, S. FUJIWARA, T. IMANAKA, H. HIGASHIBATA: “Analysis of the DNA polymerase B disruptant of hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis.” Extremophiles2012 The 9th international congress on Extremophiles, Sevilla, Spain, 2012.9.13
  14. ○H. HIGASHIBATA, T. IMANAKA: “Disruption of genes involved in archaeosine biosynthesis in hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis.” Thermophiles2011 The11th international conference on Thermophiles research, Bigsky, Montana, America, 2011.9.13　
  15. ○T. KUSHIDA, S. FUJIWARA, T. IMANAKA, and H. HIGASHIBATA: “Disruption of the gene encoding DNA polymerase B in hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis.” Thermophiles2011 The11th international conference on Thermophiles research, Bigsky, Montana, America, 2011.9.13

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学会発表【国内学会・研究会・講演会での発表】（2011-2019）○印は発表者を示す。

  1. ○櫛田卓志、鳴海一成、石野園子、石野良純、東端啓貴：“DNAポリメラーゼDを過剰発現させたThermococcus kodakarensis polB遺伝子破壊株のDNA損傷ストレス感受性” 日本Archaea研究会第32回講演会　川越（2019年7月20日）
  2. ○櫛田卓志、鳴海一成、石野園子、石野良純、東端啓貴：“Thermococcus kodakarensis polB遺伝子破壊株におけるPolD過剰発現の試み” 日本Archaea研究会第29回講演会　東京（2016年7月7日）
  3. ○東端啓貴、櫛田卓志、鳴海一成、石野園子、石野良純、藤原伸介、今中忠行：“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisのDNAポリメラーゼBの役割” 微生物学の新たな発展、ゲノムから機能・実用に関する九州シンポジウム　宮崎（2015年12月7日）
  4. ○櫛田卓志、鳴海一成、石野園子、石野良純、藤原伸介、今中忠行、東端啓貴：“Thermococcus kodakarensis polB遺伝子破壊株の熱ショックに対する感受性の解析” 第15回極限環境生物学会年会　沖縄、今帰仁村コミュニティーセンター（2014年11月2日）
  5. ○櫛田卓志、鳴海一成、石野園子、石野良純、藤原伸介、今中忠行、東端啓貴：“Thermococcus kodakarensisにおけるpolB遺伝子破壊株の表現型解析と相補実験” 第14回極限環境生物学会年会　神奈川、明治大学生田キャンパス（2013年10月27日）
  6. ○東端啓貴、川崎愛美、今中忠行：“Thermococcus kodakarensisのアーキオシン生合成関連遺伝子破壊株の熱ショック感受性” 第14回極限環境生物学会年会　神奈川、明治大学生田キャンパス（2013年10月26日）　
  7. ○東端啓貴、櫛田卓志、鳴海一成、藤原伸介、今中忠行：”Thermococcus kodakarensis ΔpolB株のDNA損傷ストレス感受性と相補実験”　 日本Archaea研究会第26回講演会　東京（2013年7月20日）
  8. ○櫛田卓志、鳴海一成、藤原伸介、今中忠行、東端啓貴：“Thermococcus kodakarensis のpolB 遺伝子破壊株の表現型解析”　第13回極限環境生物学会年会　東京、日本大学文理学部（2012年12月1日）
  9. ○田中大地、櫛田卓志、小野優樹、藤原伸介、今中忠行、東端啓貴：“Thermococcus kodakarensis におけるインテイン除去株の作製” 第13回極限環境生物学会年会　東京、日本大学文理学部（2012年12月1日）
  10. 櫛田卓志、鳴海一成、藤原伸介、今中忠行、○東端啓貴：“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis DNAポリメラーゼB遺伝子破壊株のDNA損傷ストレス感受性の解析” 変異機構研究会・第25回夏の学校　愛知県小牧勤労センター（2012年7月1日）
  11. ○櫛田卓志、倉内康行、鳴海一成、藤原伸介、今中忠行、東端啓貴：“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis のDNA polymerase Bは細胞の生育に必須ではない” 日本農芸化学会2012年度（平成24年度）大会　京都（2012年3月23日）
  12. ○東端啓貴、大久保一成、今中忠行：“Thermococcus kodakarensisのアーキオシン生合成関連遺伝子破壊株の増殖特性” 第12回極限環境生物学会年会　長崎、長崎大学・良順会館（2011年11月28日）
  13. ○伊藤幸輝、東端啓貴：“Sulfolobus acidocaldariusの細胞増殖に与える抗生物質の影響” 第12回極限環境生物学会年会　長崎、長崎大学・良順会館（2011年11月28日）
  14. ○山城安紀子、櫛田卓志、藤原伸介、今中忠行、東端啓貴：“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisにおけるインテイン除去株の増殖特性” 第12回極限環境生物学会年会　長崎、長崎大学・良順会館（2011年11月28日）
  15. ○倉内康行、櫛田卓志、鳴海一成、藤原伸介、今中忠行、東端啓貴：“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis DNA Pol B破壊株のDNA損傷ストレス感受性” 第12回極限環境生物学会年会　長崎、長崎大学・良順会館（2011年11月28日）
  16. ○櫛田卓志、鳴海一成、藤原伸介、今中忠行、東端啓貴：“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisにおけるDNA polymerase B遺伝子破壊株の特徴” 第12回極限環境生物学会年会　長崎、長崎大学・良順会館（2011年11月27日）
  17. ○櫛田卓志、藤原伸介、今中忠行、東端啓貴：“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来DNA polymerase Bの機能解析” 日本農芸化学会関東支部2011年度大会　東洋大（群馬）（2011年10月15日）ポスター賞受賞
  18. ○東端啓貴、櫛田卓志、藤原伸介、今中忠行：“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisにおけるインテイン除去の試み”日本農芸化学会関東支部2011年度大会　東洋大（群馬）（2011年10月15日）
  19. ○櫛田卓志、藤原伸介、今中忠行、東端啓貴：“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisのDNA polBは細胞の生育に必須ではない”日本農芸化学会2011年度（平成23年度）大会　京都（2011年3月26日）（東日本大震災により中止）
  20. ○東端啓貴、馬渡麻未、今中忠行：“アーキオシン生合成遺伝子破壊株の増殖特性” 日本農芸化学会2011年度（平成23年度）大会　京都（2011年3月26日）（東日本大震災により中止）

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講演（2012-2017）

  1. ○東端啓貴、櫛田卓志、鳴海一成、石野園子、石野良純、藤原伸介、今中忠行：“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisのDNA合成酵素遺伝子に関する分子遺伝学的解析”2017年度生命科学系学会合同年次大会（ConBio2017）　神戸ポートアイランド（2017年12月9日）
  2. ○東端啓貴、櫛田卓志、鳴海一成、今中忠行、藤原伸介、“超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来DNAポリメラーゼBのDNA修復における役割”日本遺伝学会第84回大会　福岡、九州大学医学部百年講堂・同窓会館（2012年9月24日）

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競争的研究資金

  1. 若手研究（B）（平成20年度〜平成22年度）“アーキア特異的tRNA修飾システム（アーキオシン生合成経路）の解明” （代表）
  2. 萌芽研究（平成18年度〜平成19年度）“アーキアにおけるtRNA修飾システムの解明”東端啓貴（代表）

　　
　　その他、学内助成金4件など

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Toyo Univ.tiff



Higashibata Laboratory
in Toyo University









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